Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms