Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COPS7AQ9UBW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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