Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF1Q9UBU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms