Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP28Q9P2N2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms