Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDP1Q9P0J1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDP1Q9P0J1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDP1Q9P0J1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDP1Q9P0J1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms