Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms