Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX02

NLRP2, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP2Q9NX02 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP2Q9NX02 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP2Q9NX02 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms