Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRT84Q9NSB2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT84Q9NSB2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms