Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.073e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-205ENST00000444954 598 ntTSL 321.21■□□□□ 0.993e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF16-203ENST00000507768 757 ntTSL 220.81■□□□□ 0.922e-37■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 FAR2-209ENST00000551451 539 ntTSL 420.74■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 520.05■□□□□ 0.83e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-206ENST00000502531 1056 ntTSL 319.75■□□□□ 0.753e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 DHX34-204ENST00000486327 2897 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 CRELD2-207ENST00000462253 471 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 CRY2-203ENST00000473199 536 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 CRY2-209ENST00000532390 535 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF16-202ENST00000507731 533 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-37■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 C16orf91-202ENST00000563974 1005 nt17.88■□□□□ 0.453e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 517.78■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 517.28■□□□□ 0.363e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 AP000347.2-203ENST00000434893 403 ntTSL 216.21■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 REXO1-206ENST00000588743 369 ntTSL 316.17■□□□□ 0.183e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-203ENST00000435662 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.55■□□□□ 0.083e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-205ENST00000502434 984 ntTSL 515.39■□□□□ 0.053e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 515.34■□□□□ 0.053e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-209ENST00000506532 677 ntTSL 214.45□□□□□ -0.13e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-37■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 314.11□□□□□ -0.153e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-215ENST00000544543 883 ntTSL 514.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ZC3H4-204ENST00000597069 664 ntTSL 413.95□□□□□ -0.183e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-210ENST00000491286 851 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ACSF3-216ENST00000562204 581 ntTSL 313.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-205ENST00000460898 491 ntTSL 313.45□□□□□ -0.263e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-204ENST00000528264 511 ntTSL 513.36□□□□□ -0.273e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 CRY2-210ENST00000533779 524 ntTSL 413.08□□□□□ -0.323e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-214ENST00000508962 293 ntTSL 313.07□□□□□ -0.323e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 NUB1-202ENST00000460712 664 ntTSL 213.02□□□□□ -0.333e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.393e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 212.58□□□□□ -0.43e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 RNF215-205ENST00000431544 535 ntTSL 312.56□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 GMPPA-206ENST00000435316 786 ntTSL 512.32□□□□□ -0.443e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 AP000347.2-201ENST00000423913 584 ntTSL 511.73□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 HAUS7-204ENST00000437046 543 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 NUB1-207ENST00000480714 586 ntTSL 211.22□□□□□ -0.613e-14■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 UPF3B-201ENST00000276201 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 210.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-206ENST00000504477 2039 ntTSL 58.76□□□□□ -1.013e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 XPC-206ENST00000477324 554 ntTSL 28.74□□□□□ -1.013e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-213ENST00000512256 583 ntTSL 38.43□□□□□ -1.063e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-215ENST00000510135 1376 ntTSL 28.23□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 NFIX-211ENST00000588680 319 ntTSL 58.17□□□□□ -1.13e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 FAR2-204ENST00000547411 558 ntTSL 47.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 XPC-204ENST00000455144 958 ntTSL 47.42□□□□□ -1.223e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 SAMM50-202ENST00000465768 169 ntTSL 36.77□□□□□ -1.333e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 DHX34-203ENST00000471451 426 ntTSL 56.6□□□□□ -1.353e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 LEF1-214ENST00000509428 1090 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-210ENST00000554137 384 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-16■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.533e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 XPC-203ENST00000452172 571 ntTSL 45.35□□□□□ -1.553e-19■■■■■ 242.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.621e-9■■■■■ 242
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.51e-9■■■■■ 242
UTP3Q9NQZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.391e-8■■■■■ 241.7
UTP3Q9NQZ2 AL512590.3-204ENST00000529787 5586 ntTSL 211.82□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 241.5
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 28.84□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 241.5
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 241.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 241.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 241.2
UTP3Q9NQZ2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-10■■■■■ 241
UTP3Q9NQZ2 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 241
UTP3Q9NQZ2 PARP2-206ENST00000529465 717 ntTSL 48.32□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 241
UTP3Q9NQZ2 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 241
UTP3Q9NQZ2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 240.9
UTP3Q9NQZ2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 240.9
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-213ENST00000529650 479 ntTSL 223.26■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 240.8
UTP3Q9NQZ2 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-204ENST00000358062 6773 ntTSL 58.36□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.152e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.622e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.782e-9■■■■■ 240.7
UTP3Q9NQZ2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 240.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-213ENST00000641272 758 nt17.77■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 240.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 576 ms