Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPHNQ9NQX3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms