Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRMS1Q9HCU9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms