Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAF1Q9H7N4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF1Q9H7N4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms