Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3Q9BY71 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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