Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP58Q9BVL2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms