Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP8Q9BV40 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms