Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms