Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms