Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms