Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT74Q96LB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms