Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCARF2Q96GP6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF2Q96GP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms