Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUB2Q96DC9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms