Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC127Q96BQ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms