Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY2Q8WXA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY2Q8WXA3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms