Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms