Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NGDNQ8NEJ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGDNQ8NEJ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms