Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP18Q8NEJ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP18Q8NEJ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP18Q8NEJ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP18Q8NEJ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP18Q8NEJ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP18Q8NEJ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms