Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00301Q8NCQ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms