Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L3Q6VB84 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L3Q6VB84 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms