Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMBQ6NW40 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMBQ6NW40 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms