Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF20Q5VTR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF20Q5VTR2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms