Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIVEP3Q5T1R4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms