Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FRMPD1Q5SYB0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms