Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIN3Q5JUX0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms