Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC9B1Q4ZJI4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9B1Q4ZJI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms