Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HIST2H2BEQ16778 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HIST2H2BEQ16778 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HIST2H2BEQ16778 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HIST2H2BEQ16778 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HIST2H2BEQ16778 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIST2H2BEQ16778 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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