Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRF1Q16656 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRF1Q16656 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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NRF1Q16656 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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