Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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