Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD6Q15008 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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