Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARB2Q14108 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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