Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A6Q14031 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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