Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P11Q13670 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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