Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTMR3Q13615 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms