Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EIF4EBP1Q13541 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EIF4EBP1Q13541 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms