Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C1orf61Q13536 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf61Q13536 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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