Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DYNC1I2Q13409 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DYNC1I2Q13409 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms