Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3FQ13275 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms