Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFRD2Q12894 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFRD2Q12894 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms