Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TWF1Q12792 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms