Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 RPC10YHR143W-A 213 nt5.27□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YHR212CYHR212C 336 nt5.27□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YJL022WYJL022W 309 nt5.27□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YAR060CYAR060C 336 nt5.27□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SAP30YMR263W 606 nt5.27□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SSH4YKL124W 1740 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 CDC9YDL164C 2268 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 MRPL39YML009C 213 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 LAS21YJL062W 2493 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 NUP60YAR002W 1620 nt5.26□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 RPA12YJR063W 378 nt5.25□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YLR346CYLR346C 306 nt5.25□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 GRS1YBR121C 2004 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 ICR1ICR1 3199 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YEL073CYEL073C 324 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 RPS24AYER074W 408 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 TIM13YGR181W 318 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 LSM1YJL124C 519 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 CSE2YNR010W 450 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 HHT1YBR010W 411 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SPC97YHR172W 2472 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 PIG1YLR273C 1947 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 NAN1YPL126W 2691 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 ASK10YGR097W 3441 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 GAS3YMR215W 1575 nt5.24□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 GMC1YDR506C 1827 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SYG1YIL047C 2709 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 VAM7YGL212W 951 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YIL141WYIL141W 390 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YPL080CYPL080C 327 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 PRM1YNL279W 1986 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 VPS41YDR080W 2979 nt5.23□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 DSL1YNL258C 2265 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 PMP1YCR024C-A 123 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 GSY1YFR015C 2127 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YIL174WYIL174W 228 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YKR033CYKR033C 426 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 PFY1YOR122C 381 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YOR333CYOR333C 417 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SGF11YPL047W 300 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 OLE1YGL055W 1533 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SRB4YER022W 2064 nt5.22□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 PMA1YGL008C 2757 nt5.21□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 SEC5YDR166C 2916 nt5.21□□□□□ -1.57
NCR1Q12200 YDR341CYDR341C 1824 nt5.21□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPS8BYER102W 603 nt5.21□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.21□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPS22BYLR367W 393 nt5.21□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 NHP6AYPR052C 282 nt5.21□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YOR1YGR281W 4434 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 PRS5YOL061W 1491 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 REV1YOR346W 2958 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 PSE1YMR308C 3270 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RNA14YMR061W 2034 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 BRP1YGL007W 378 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YKL111CYKL111C 336 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPS27AYKL156W 249 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YLR282CYLR282C 342 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPL16BYNL069C 597 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 VID30YGL227W 2877 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YTA6YPL074W 2265 nt5.2□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 ARF1YDL192W 546 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 SUI1YNL244C 327 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPL32YBL092W 393 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 RPB11YOL005C 363 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 snR10snR10 245 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 CPS1YJL172W 1731 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 TPS3YMR261C 3165 nt5.19□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 SYP1YCR030C 2613 nt5.18□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 HAP1YLR256W 4509 nt5.18□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YCR050CYCR050C 309 nt5.18□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 JJJ2YJL162C 1752 nt5.18□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 ADE6YGR061C 4077 nt5.18□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YDR250CYDR250C 276 nt5.17□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YDR442WYDR442W 393 nt5.17□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 AIM9YER080W 1884 nt5.17□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 SAF1YBR280C 1914 nt5.17□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YGR250CYGR250C 2346 nt5.17□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 ATP22YDR350C 2055 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 ACK1YDL203C 1872 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 SSH1YBR283C 1473 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 DAL81YIR023W 2913 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 PDE2YOR360C 1581 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 DNM1YLL001W 2274 nt5.16□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YLR001CYLR001C 2589 nt5.15□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 GRS2YPR081C 1857 nt5.15□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 SWI3YJL176C 2478 nt5.15□□□□□ -1.58
NCR1Q12200 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt5.15□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 NKP2YLR315W 462 nt5.15□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt5.15□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 GLT1YDL171C 6438 nt5.15□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YDR338CYDR338C 2088 nt5.14□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 ECM12YHR021W-A 456 nt5.14□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 GOT1YMR292W 417 nt5.14□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YPR014CYPR014C 330 nt5.14□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 ROT2YBR229C 2865 nt5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.3 ms