Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBRQ0VD83 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms